研究报告

基于 SRAP 标记和 ITS 序列分析西番莲属种质资源遗传多样性  

夏玲 , 龚家建* , 梁昕景 , 王锋堂 , 马亚龙 , 曹明
三亚市南繁科学技术研究院, 三亚, 572000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 38 篇   
收稿日期: 2019年10月21日    接受日期: 2019年10月31日    发表日期: 2020年08月28日
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摘要

本研究基于 SRAP 标记和 ITS 序列对 11 份西番莲种质进行遗传多样性分析。结果表明,SRAP 标记分析时从 70 对引物组合中筛选出 9 对重复性好,条带清晰的引物组合,共扩增出 110 个条带,平均每组引物可扩增 12.22 个条带,多态性条带占 84.93%UPGAM 聚类可以将 11 个西番莲样品分为 5 个类群,第一类:‘哥伦比亚热情果’,‘巨无霸’;第二类:‘黄金果’,‘台农 1 号’,‘满天星’和‘天王星’;第三类:‘蓝香’和‘瑞香’;第四类: ‘玛格丽特’;第五类: ‘龙珠果’。ITS 序列分析时,11 个西番莲样品 ITS 序列长度为 667 bp,变异位点为 162 个,单倍型 10 个,单倍型多样性0.982,核苷酸多样性 0.071。采用 NJ 法对 11 个样品构建系统进化树可分为 4 大支, ‘哥伦比亚热情果’, ‘巨无霸’为一支; ‘蓝香’, ‘瑞香’和‘玛格丽特’为一支; ‘金霸’,‘黄金果’, ‘台农 1 号’, ‘满天星’和‘天王星’为一支。通过两种方法分析均能很好地将 11 个西番莲样品区分开来,结果基本一致,且与其属种相吻合,说明 SRAP 标记和 ITS 序列对西番莲进行分类是可行的。因此,西番莲遗传多样性能更好地开发和利用种质资源,为西番莲育种与品种鉴定提供科学依据。
 

关键词
西番莲(Passiflora caerulea);SRAP;ITS 序列;遗传多样性;亲缘关系

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《分子植物育种》印刷版
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